在小智等人的共同努力下，成功的改變了歷史，讓阿爾宙斯解開了誤會，沒有對人類產生隔閡。
阿爾宙斯也知道了簽訂契約的達摩斯的心意，所以沒有怪罪。
而這片大地失去了生命寶珠的力量，開始了崩潰，但是阿爾宙斯卻用盡了全部的能量，維持了這片大地的生命力。
只是它也因此需要陷入長眠，進行恢復。
結果上似乎是一樣，但本質上卻大為不同。
經過這件事，阿爾宙斯是心甘情願的回應著達摩斯的心意。
「感謝你們，達摩斯，小智，皮卡丘……」
阿爾宙斯隨即看向小智身邊的希羅娜她們還有後面成群結隊的神奇寶貝們：「還有，親愛的各位。」
話音落下，阿爾宙斯的身影飛翔到了高空，進入了次元隧道，準備長眠。
小智他們的身上也閃爍起了光芒，是帝牙盧卡在呼喚他們了。
「那麼我們就先回去了，達摩斯先生。」
小智朝著達摩斯微笑道。
「原本還想跟你們繼續聊聊的。」
達摩斯有些不舍的說道：「感謝你們，未來的孩子們。」
「未來嗎…」
咻！
*
現世。
「沙喏…」
沙奈朵被餘波的暴風衝擊砸在了遺址內，想要起身，這次卻是怎麼也動了不了。
堅持到現在，不僅是小智的神奇寶貝還是三龍都已經徹底的被阿爾宙斯擊潰，沒有了一絲戰鬥能力。
「小智先生！」
這時，希娜和賓客看到了憑空返回的小智一行人，剛喊完，阿爾宙斯便再次揚起腦袋，釋放起了龍星群！
「怎麼會？！」
莎莉娜和希羅娜都有些愕然，她們明明不是已經改變了歷史嗎？
「豈可修！」
小智環視了一圈沙奈朵和噴火龍它們，知道大家已經盡力了。
他從希羅娜和莎莉娜的攙扶下跑到前方，大喊道：「阿爾宙斯！」
「這孩子……」
阿爾宙斯眼中的紅光一頓，緩緩恢復成了翠綠色。
天空中的龍流星也在這一刻停滯了下來。
無數的數據在阿爾宙斯的瞳孔中流轉，阿爾宙斯認出了眼前的少年：「小智…」
「看來世界線成功收縮了…」
小智見狀，長出一口氣。
周圍被破壞的事物都在下一刻恢復到了原狀，包括神殿遺址都從破爛不堪變成了具有悠久歷史氣味的建築。
「神殿竟然…」
希娜小姐震撼的看著這一幕，張大了嘴巴。
「歷史……逐漸被修復了……」
希羅娜也是有些驚訝，驚訝於歷史改變後帶來的影響。
金色的陽光刺破黑暗，透過雲層散落在這片大地之上，照映著勃勃生機。
阿爾宙斯周身浮現出石板，那缺少的一部分已經復原，隨著它重新收回體內，在場的神奇寶貝們也瞬間回到了滿血狀態。
帝牙盧卡，帕路奇犽，騎拉帝納都飛到了阿爾宙斯的身後。
「太好了！」
「一切都恢復原狀了！」
「不過竟然是幾千年的時間，這片大地又失去了生命寶玉，為什麼會比我們在回去看到的要變得更加的繁榮了呢？」
希羅娜這時望著眼前的景象，不禁出聲道。
「那是因為你們的祖先拼命耕耘了這片大地，所以就算後面生命能量逐漸消散，這片大地也因為人類和神奇寶貝的努力復甦了屬於這片大地的生機。」
阿爾宙斯飄浮到他們的身前，說道。
「是這樣啊！」
聞言，小智三人開心的對視一笑。
至此，事件成功圓滿解決。
從神殿門口豎立的石碑上，希娜小姐明白了自己的祖先不是所謂的背叛者和欺騙者，喜極而泣。
帝牙盧卡，帕路奇犽和騎拉帝納各自回到了自己的空間。
阿爾宙斯則是從自己的石板中，調取出了三道本源之力匯聚的珠子送給了小智三人作為答謝。
因為它說幾千年前自己急於回到空間長眠，所以沒有來得及交給他們。
分別是一顆雷系的本源之珠，一顆龍系的本源之珠，還有一顆妖精系的本源之珠。
小智覺得對方應該是察覺到了皮卡丘體內仿製的石板，所以才想到了這個。
就是不知道吸收了本源之力後，這塊仿製的會發生怎麼樣的變化。
而希羅娜的那顆龍系的本源之珠自然是給了烈咬陸鯊，吸收當場就學會新絕招：龍之舞！
「小智，希羅娜姐，這個我的火狐狸可以用嗎？」
莎莉娜把玩著手中的粉色珠子，不禁發問。
既然是那麼厲害的神奇寶貝贈送的東西，肯定不一般，但她的話一出，算是觸及到希羅娜的知識盲區了。
因為照理來說，同屬性吸收同屬性的本源，不同屬性的肯定會出現排斥的狀況。
但是希羅娜自己也是第一次拿到這種東西，所以看向了見多識廣的小智。
「嗯，這個嘛…」
小智眉頭微微一攪，也是陷入了思考。
你說這玩意不行吧，路卡利歐，波加曼都在獲得類似的祝福後，收穫了額外的附魔。
不過這些祝福都是擁有本源的前提下的雙屬性，至於阿爾宙斯贈予的會不會比較特殊，小智不知道。
但唯一可以肯定的就是，火狐狸絕對沒有皮卡丘特殊。
所以在慎重考慮下，小智還是告訴了莎莉娜最好還是以後收服到妖精系的神奇寶貝後，再使用這顆珠子。
告別米季納的當天，希娜和克賓送別了小智他們。
「嗯~」
小智站在甲板上舒服的伸了個懶腰，在解決完事情過後，他帶著莎莉娜和希羅娜在米季納多待了一段時間，讓皮卡丘適應體內能量的同時，還給神奇寶貝們放了放風。
至於希羅娜的話，在前幾天就因為有事，所以提前離開了。
現在他們乘坐著對戰王座，開始返回合眾地區。
從芽衣和透子那邊傳來的信息來看，在他們分別後，兩女的旅程還算圓滿。
目前的話，芽衣這邊進步最大，後面一連參加了兩場華麗大賽，都獲得了緞帶勳章。
只是其中一次，彌華並沒有參賽的樣子。
而透子，則是在拿到飛雲道館的徽章後，也不知道是出於什麼原因，一直在埋頭訓練，目前在徽章數上面沒有什麼進展。
現在兩人即將抵達雷紋市，準備透子第四個道館的道館挑戰賽。