小故事1庫庫伊博士的悲哀。
在莎莉娜離開了之後，小智也將小醬傳送給了莎莉娜。
在那之後，由於小智的研究員身份必須得擁有足夠的知識，所以小智和小茂跟隨大木博士，來到了阿羅拉。
但是小智並沒有去認識原著阿羅拉的同伴們。
而是一個人秘密的跟著庫庫伊博士學習。
並成為了庫庫伊博士的學生，整天跟在庫庫伊博士的後面學習。
小智和庫庫伊博士的關係也越來越好。
而小智與皮卡丘也在不斷的訓練，他們兩個的感情越來越深。
某一天，庫庫伊博士對小智說：「小智，你這孩子不出去玩，一天到晚除了和皮卡丘在一起玩，就是看書和玩手機，你不會覺得寂寞的嘛。」
「啊？不會啊，我不是還有庫庫伊博士你和我在一起嗎。」小智笑著回答。
庫庫伊博士伸手揉了揉小智的。
「你這個孩子真的是，猜不透你啊！」庫庫伊博士無奈的說。
「那有啊，對吧皮卡丘。」小智笑著對皮卡丘說。
「哦，對了小智，你每天晚上都在和誰打電話？」庫庫伊博士好奇的問道。
「我的女朋友，怎麼了嗎？」小智有些不解。
「你年紀才多大啊，就有女朋友了？」庫庫伊博士有些疑惑。
「喂，庫庫伊博士，你不要因為你沒有女朋友就覺得我也沒有哦。」小智用的鄙視的語氣對庫庫伊博士說。
「小智你能不能說話，不要說的那麼直白啊。」庫庫伊博士的心碎了。
「不能，說話太過於婉轉的話，會讓對方誤解自己的意思的。」小智邊逗著皮卡丘邊說道。
「啊，這也可以！」庫庫伊有些崩潰。
而小智則是用超能力支撐著庫庫伊博士。
「那你能讓我認識一下你的女朋友嗎？我倒要看看你的女朋友是什麼樣的。」庫庫伊博士質疑的說道。
「好啊，但是你什麼時候能給我找個師母啊。」小智看著庫庫伊博士。
「這個嘛，這東西都得看緣分了。」庫庫伊博士為自己辯解。
「算了，反正到最後孤獨終老的又不是我。」小智一臉無所謂。
「臭小子，我要讓你感受一下來自我對你的愛吧。」隨後，庫庫伊博士對著小智的頭來了一記愛的鐵拳。
「好痛啊。」小智捂著頭。
而皮卡丘則是在一旁看著兩人在那裡笑著。
晚上，小智拿著手機等著莎莉娜的視頻電話。
哎，庫庫伊博士則是帶著皮卡丘在一旁準備吃狗糧。
而皮卡丘原本是想逃走的，但是被庫庫伊博士用一瓶番茄醬收買了。
差不多等了十多分鐘，莎莉娜終於打電話過來了。
小智拿起手機給庫庫伊博士看，而手機上赫然寫著『莎莉娜』三個大字。
「你接呀。」庫庫伊博士還是不信邪。
隨即小智按下了接聽。
電話里先傳出了一道甜美的聲音，隨後莎莉娜出現在屏幕上。
「小智你怎麼那麼遲才接電話呀。」莎莉娜可愛的樣子，小智永遠看不膩。
「抱歉了，有點事情，耽誤了一下。」小智繞了繞頭。
「沒事就好，對了小智，今天我和伊布帶著小醬出去散步，不知道為什麼，有很多人來說要和我交換神奇寶貝。」莎莉娜有點不解。「而且那些人里有一個人，想要拿一隻粘粘寶和一隻向尾喵來，想要交換小醬和伊布。
「啊！那你沒有換吧。」小智聽完後立馬問道。
「笨蛋，我怎麼可能會換啊，伊布是我的第一隻神奇寶貝，而小醬是我和小智你的孩子，我是絕對不會換的，不是嗎。」莎莉娜雖然非常害羞，但是她那堅定的眼神也讓小智有些欣慰。
「嗯，那小醬和伊布那去了？」
「小醬和伊布在媽媽那裡玩呢。」
「小醬、伊布～」莎莉娜走開去叫小醬和伊布了。
「你小子來真的啊。」庫庫伊博士有些震驚。
「肯定的啊，不然呢。」小智有些不在意的說道。
一會後，電話的另一邊，莎莉娜抱著小醬和伊布回來了。
「伊伊布」小醬看見小智很高興。
「伊布伊」伊布也對小智問了一聲好。
「小醬在媽媽那裡，有沒有乖乖聽話啊。」小智滿臉笑意看著小醬。
「我家小醬肯定是乖乖的是不是啊小醬。」莎莉娜抱著小醬。
「伊布伊布」小醬開心的叫道
小智也溫柔的看著莎莉娜和小醬、伊布。
「砰」而這時，庫庫伊博士抱著皮卡丘不小心動了一下。
「小智你那邊有人嗎？」莎莉娜警惕起來。
「那個嘛……」小智不知道該怎麼回答。
「難不成，小智背著我在外面找了別的女孩子，難怪小智剛才那麼遲才接電話，嗚嗚嗚。」 說著莎莉娜開始流下了眼淚。
「不是啊，莎莉娜乖，不是說好不哭的嗎。」小智看著莎莉娜在那裡哭，心裡發疼。
「那你說那聲音是怎麼出來？」莎莉娜對小智問道。
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「出來吧，其實是因為他們倆個。」小智把庫庫伊博士和皮卡丘拉了出來。
「那個，阿羅拉。」「皮卡丘丘」庫庫伊博士和皮卡丘，不好意思的打了聲招呼。
最後，再經過小智和庫庫伊博士加上皮卡丘的一通解釋後，莎莉娜終於放下心來。
而阿羅拉的故事，暫時就先放這一段了。
（我主要是想讓庫庫伊博士提前出場～(￣▽￣～)~，提前為後面做一下鋪墊。）
而後來，小智在阿羅拉地區見識了Z招式，和認識了美樂美樂島上的穿著熊（卡噗·熊熊），而且還見到了卡噗·鳴鳴，就這樣，小智在阿羅拉地區學習了三年時間。
而小茂則是跟著大木校長去學習了。
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小故事2長大的小茂和變小的赤紅。
時間一緩，小智在阿羅拉地區學習了三年，也回來了。
而小智將三台自由學習機的其中一台換成了鐵尾的技能教學。
皮卡丘也也學會了鐵尾。
有一天，小智正帶著皮卡丘走在去往大木研究所的路上。
「系統打開個人面板。」
「叮，已打開。」
宿主：小智
年齡：8歲
訓練家等級：
能力：波導之力(中級)、常磐之力(中級)、超能力(中級)、超級真新人、情感之力、廚藝大師
物品:自由技能教學機×2、神奇糖果×5、自由鐵尾教學機、資質提升藥×3、
樂觀點:5792點
任務：
在成為神奇寶貝研究員之後，小智每個月都能領取到聯盟發下來的獎金。
而在之前前往阿羅拉的時候，系統也突然更新。
系統更新完了之後，小智發現，只要他每做過一件能讓自己或者讓大家開心的事情，他就能領取到樂觀點。
好比如對莎莉娜說一段真心的情話，就可以領取樂觀點。
對媽媽說一句我愛你，然後抱一抱媽媽的時候，也可以獲得樂觀點。
和皮卡丘一起獲得戰鬥的勝利的時候，也可以獲得樂觀點。
而且自從小智成為研究員的那一天之後。
小智將自己把夢幻的視頻買給大木博士的那筆錢交給了花子媽媽，然後花子媽媽就拿去了理財，後來，花子成為了真新鎮的一位名副其實的富婆。
這也為了小智以後到旅行基金打下了基礎。
而現在，小智來到了大木研究所的門前。
只見小智拿出鑰匙，熟練的打開門。
一開門，小智便看見了研究所門口的一的沙發上坐著的人。
「小茂！」小智驚訝的說道。
「赤紅！」而坐在沙發的那個人也驚訝的對小智說道。
「小茂（赤紅）你怎麼變大（小）了。」兩邊同時喊道。
「皮卡丘～」（搞什麼烏龍啊～）而在一旁的皮卡丘則是無奈的在那裡看著。
隨後，小智率先反應過來。「不對，你不是小茂，你是青綠？！」
「可是我來到這個世界那麼多年，怎麼沒聽過遊戲裡的歷代主角的新聞。」小智心裡想到。
「喲，小鬼，你認識我，看來本大爺的名聲還是挺大的。」青綠自誇道。
「你的名聲的確挺大的，好不容易登上了冠軍寶座，然後坐了沒有半天就讓赤紅給踢了下來，真不愧是你呀半日冠軍。」小智開啟嘲諷模式。
「臭小子，你說什麼？」青綠一聽到這句話，立馬炸毛了。
「你這麼想聽，我就再跟你說一次，我說你是半日冠軍。」小智接著嘲諷。
「臭小子，你別跑。」青綠想要抓住小智給他揍一頓。
而我們的主角小智一看見青綠炸毛了，立馬帶著皮卡丘，腳底抹油溜溜球。
「不跑的是傻子。」「皮卡皮卡」
「臭小子，你不要讓我給你捉住了哈。」青綠對小智威脅道。
「你先捉得住我再說。」小智梅開二度。
就這樣一大一小和一皮在大木研究所的後院裡追逐奔跑。
而在他們追逐的途中，遇見了大木博士。
大木博士一看見青綠心裡邊罵邊追著小智的時候，頓時心裡就認定為青綠在欺負小智。
隨後，大木博士氣沖沖的追了上去，捉住青綠往後一提，讓青綠感受了一下來自爺爺的關愛。
「爺爺你打我幹什麼啊，下輕點手啊，爺爺。」青綠的慘叫響遍了整個研究室。
「臭小子可以啊，平時欺負普通訓練家就算了，現在你踏馬的還欺負起小孩來了，老夫是怎麼教你的，尊老愛幼，你不知道了嗎。」就這樣，大木博士讓青綠感受了一下爺爺的關愛。
那場面那叫一個壯烈，在現場和皮卡丘吃瓜看戲的小智，他當時的評價是，大木博士這人可以處，有孫子，他是真敢打呀。
而那天聽到青綠慘叫聲的人和神奇寶貝呢，那叫一個聞者傷心，聽者落淚。
後來，小智和青綠互相道了歉，讓大木博士的心裡有了一點安慰。
而這件事就這樣過去了。
而晚上回來的小茂看到了睡在沙發上，打身上打滿石膏的青綠，好奇的問道。「表哥是誰？把你打成這個樣子的。」
「小茂，你被爺爺揍過嗎？」青綠對小茂問道。
「沒有啊？怎麼了嗎表哥？」
而青綠聽著小茂的回答，然後他陷入了沉思。
自那天起，青綠再也不敢隨便欺負人了。
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其實這一張也只是個過渡章而已。
為後面的劇情做一下鋪墊。
可能會有一些水，請見諒。