在外旅行許久後，小智也終於回到了自己的家，而現在的家中……
「花子阿姨，小智平時在家都睡得這麼晚的嗎？」小霞不解的問，平時旅行的時候，小智最晚也就六點半才醒，今天卻睡到了八點，屬實有點強差人意。
「嗯，小智還有小皮那兩個孩子，平時在家都很喜歡睡覺的呢。」花子媽媽擺好碗筷，然後看向在一旁掃地的魔牆人偶：
「魔偶醬，辛苦你去叫一下小智他們嘍~」
「巴哩~」魔牆人偶拍了拍自己的胸口，然後便帶著吸塵器走上了樓。
來到樓上，魔牆人偶想要直接打開小智的門，卻發現門反鎖了……
他只好往裡面大叫：「巴哩！」
「唔？嗷嗚……」小智困惑的從床上爬起來，「好了……我知道啦~」
魔牆人偶聽到小智的聲音，便走下樓去了。
「哎呀~困困……皮卡丘？」看著在一旁熟睡的皮卡丘，小智有點無奈的笑了笑，隨後伸手摸向那小肚子，開始輕輕的揉了起來。
「皮卡丘~該起床了~」
「皮卡~皮？」
感受到小智的撫摸，皮卡丘緩緩睜開了雙眼，然後伸出兩隻小手手抓住了他的手，看來是還沒有享受夠呢。
「嗯嗯……」看著皮卡丘這副可愛的模樣，小智的臉上忍不住掛上了寵溺的笑，「好了，我們該下去吃早餐了。」
「皮卡！_\\(≧▽≦)/_」
在經歷洗漱吃早飯等事情後，小智他們便前往大木研究所。沒走幾步路，他們便到了。
嗡！
在小智準備打開大木研究所門口的時候，突然自天邊傳來了一陣精神波動，傳到他的腦海中響起了一聲嗡鳴。
他停下了手中的動作，扭頭看向波動傳來的方向，用著只有自己才能聽到的聲音喃喃自語道，「超夢，看來有些事情我們要處理一下了……」
「小智怎麼啦？」小霞他們看見小智突然望向天邊，有點擔心的問道。
「沒事。」小智搖了搖頭，隨後打開了研究所的大門走了進去。
「大木博士，早上好啊。」小智看著眼前這個白髮蒼蒼且精神抖擻的老人，不禁笑了笑。
「唉呀，你終於來了，小智最近過得還好嗎。」大木博士笑臉迎歡的招呼著大家。
「嗯，關鍵是你啊，您老就別吃這麼多泡麵了。」小智撇了撇嘴，用超能力將研究室里的泡麵杯全部給清除掉了。
「哈哈……這不是沒時間吃飯嗎。」
「算了，不跟你計較。」小智眼中藍光閃爍，將垃圾清理到離大木研究所不遠處的一個公共垃圾桶中。
「唉呀，那種小事就不用管啦，不過看見你這麼健康的模樣，這比什麼都重要啦。」大木博士領著小智他們走向一旁的休息室，只見小茂在裡面，一邊喝著紅茶，一邊吃著麵包。
「爺爺，小智的身體素質堪比怪力，哪用得著你擔心呢。」小茂喝著紅茶，日常吐槽著小智，要是認真算算的話，從小到大挨著揍，絕對不少！
見對面喝紅茶說綠茶，小智當即打起了太極拳，「啊對對對，你當初在常磐道館被干倒那回可真有出息呀，還是我把你給救醒的呢。
你這種身體這麼虛弱的人，能活到現在，真的就是個奇蹟了。」
「好啦好啦，不要再爭這些東西啦，你們可是真新鎮的希望之星哦。」大木博士欣慰地勸道。
「希望之星？」小智和小茂不約而同的坐起身來，然後不可思議的指向對方，「就這傢伙（就這二貨）？」
「沒錯，一想到我們真新鎮有兩個，可能會成為神奇寶貝大師的新人，我真是太高興了。」大木博士雙手抱胸，欣慰的說道。
「哼！」這倆冤家兄弟集體扭過頭去，誰也不看誰。
這時大鉗蟹抬著幾個茶杯走了過來，然後擺在桌上。
「辛苦你了。」大木博士笑著點了點頭。
「大鉗蟹好久不見，最近還好嗎？」跟大鉗蟹打完招呼後，小智感激的看向大木博士，「幫我把大鉗蟹養的這麼大，真的是辛苦你了，大木博士。」
「嗯，那孩子也是很有天賦的呢，只是先天性的體型小點而已，我覺得你可以在聯盟賽開始前好好的訓練一下他。」大木博士提議道。
「好。」小智點點頭。
「從我們真新鎮出發的四個人當中，收集到八枚徽章，回來的人只有你們兩個而已。」大木博士在語氣中，有著些許遺憾。
「還有兩個人，他們剛開始很順利，但是後來就陷入苦戰了，在實力上也沒有得到很大的進展。」
「原來如此。」小智低頭喝了一口茶，那兩個人估計就是因為培育方式不對，才導致無法得到有效的進展。
「現在呢，小茂的徽章是10枚，小智是8枚，兩個人都很努力呢。」
「也沒有了，一直以來最辛苦的就是皮卡丘他們，我也沒做出什麼事情。」小智輕撫著皮卡丘的腦袋。
「皮卡皮皮卡丘~」皮卡丘有點不滿的鼓了鼓臉，明明小智一直以來也很努力啊。
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「好啦~」小智將皮卡丘和波克比抱入懷中，無奈的笑了笑。
「總之你們兩個，現在參加神奇寶貝聯盟賽的目標算是實現了。」大木博士滿意的點了點頭。
「對了，爺爺這次聯盟比賽的地點，還有時間是什麼時候啊？」小茂好奇的問。
「嗯……地點是石英高原，時間的話就是兩個月之後了，所以你們兩個最近就得抓緊訓練了哦。」大木博士回答道：
「畢竟每一場聯盟大賽的參賽人手，都至少超過兩百人，在這裡面難免有那些常年深居的老怪物，所以你們要多加注意。」
「對了，說到訓練，小茂，你現在有道館級的隊伍了嗎？」小智笑著挑了挑眉。
「額…沒有……」小茂這才發現自己的隊伍中，道館級的加上水箭龜也才5隻而已，其他大多數就連40級大境都沒有過。
「嘿嘿……我現在不但有一個道館級的隊伍，而且還手捏一隻半步天王和天王級神奇寶貝哦。」小智滿臉都是得意。
「？小鬼，你回來啦？」突然一個紫色的胖身影出現在眾人眼前，定睛一看發現那原來是耿鬼。
「嗯，好久不見啦~」小智輕輕的抱住了老鬼。
「這……這好像已經不止天王級了吧……」感受著老鬼身上傳來的恐怖氣息，小茂咽了口口水。
「嗯？應該是吧~」小智笑眯眯的，看著老鬼，「對了，化石翼龍那傢伙你給我管好了嗎？」
「桀桀桀……那傢伙一不聽話我就讓他做噩夢，現在的表現還算可以。」
「呃……還行吧。」小智愣了一下，拍了拍老鬼的腦袋。
隨後他們便去參觀了一下，小智和小茂收服的神奇寶貝。大木博士也講了之前和小智一起做研究時，每天要做的事情，包括但不限於餵飯，掃地，清理，洗漱檢查等等……
要干好一大堆的事情，最後才能夠正經的開始研究。
在參觀的時候，小智也遇見了自家的化石翼龍和其他神奇寶貝，看來一個個都在這裡生活的很聽話呢。
化石翼龍也收斂了自己的性子，乖乖的跟著小智，這就是從心的力量。
而另一邊的火箭隊三傻，因為超夢逃離的事情，所以板木就放過了他們，讓他們像以前那樣干自己的事情。
不過他們剛來到大木研究所時，就被小智的神奇寶貝們給認了出來，帶領著一夥兄弟給送上了天。
到了最後小智和小茂這兩冤家兄弟，約定好在聯盟大賽的時候，一定要來一場精盡全力的對戰。