日子在琦玉陣亡之後繼續向前，變化的只是宇智波從此少了一個名叫宇智波琦玉的天才忍者，不變的是止水依舊在努力成長。
而戰爭的殘酷，還遠比止水想像中的恐怖數倍。
繼續投身戰場，他和同為宇智波護衛隊的幾名成員組成了屬於宇智波的攻堅隊，在屬於木葉的戰場角落裡不斷綻放出光彩。
但戰爭這個巨獸，最終還是選擇吞噬了他的同伴。
而屬於他體內的、被詛咒的力量也在那個時候甦醒，也是那個時候，止水明白了琦玉所說的一句話：宇智波家族想要改變窘境，要麼被黑暗吞噬，要麼有人主動去背負黑暗！
連續的失去重要的同伴，他獲得了遠超三勾玉的力量，但內心卻早已千瘡百孔。
去結束這場戰爭，去改變家族的困境，去實現當初的理想……
止水的心，一次次變得堅硬並且只對少數幾人開放，而關於他的目標，也正在逐步被實現。
四代目上任之後，宇智波家族的境地似乎得到改善，而他們這群新生代也很配合地跟隨著這位實力強大的新火影開闢著屬於他們的『疆土』。
曾經渴望依舊的目標，正在逐步被實現。
但忍界的安寧，似乎並不長久，新的風暴再次出現！
尾獸，是忍村的戰略武器，它們並不是常規意義上必須投入戰爭的武器，反而更多的是為了威懾敵方，告訴敵人自己擁有同歸於盡的能力，大家相互之間最好保持一定的尊重！
而這一次，出事的就是尾獸。
屬於岩隱的四尾人柱力老紫在草之國的邊境和未知的敵人進行了戰鬥，隨後消失不見。
而一個神秘的組織就此隱約浮現，讓最先得到有關情報的木葉以及岩隱繃緊了神經。
…
不久之後，止水收到一項任務，前往砂隱村進行情報偵察並且對盟友示警，畢竟砂隱的實力在五大裡面並不強，而他們的手裡還掌握著一隻尾獸，所以或許會是神秘組織的目標。
不過讓他沒有想到的，這次旅途居然遭遇了本已死去的同伴，令人意想不到的重逢在忍界這樣一個不起眼的沙漠中發生，但註定沒有結果。
徒一見面的那刻，止水內心的激動似乎無法被壓制。
他想走過去和琦玉說話、擁抱，想一拳打在對方的胸口，然後詢問對方為什麼既然活著都不回村子。
但世界上太多事情都充滿了戲劇性，就好比這一次兩人的重逢。
止水看著那個正在對風影下殺手的熟悉身影，之前種種的情緒都逐漸被收斂起來。
某些事情似乎在他不知道的地方發生了巨大的改變，即便是曾經親如兄弟的兩人也有覺得陌生的瞬間。
「住手！」
止水發動瞬身術消失在原地，隨後擋在風影的身前攔下了琦玉的進攻。
琦玉似乎也沒有預料到能夠在此時看到止水，臉上浮現一陣不一樣的色彩。
但許多的改變已經讓兩人成了熟悉的陌生人。
止水本以為再次見到琦玉會有數不盡的話想要說，但目光定格在對方冷漠的神情上之後，他知道，已經沒有必要了！
看來，琦玉已經不再是曾經那個愛笑的少年！止水注意道琦玉身上所穿的黑底紅雲風衣，心裡默默思索著。
作為砂隱的盟友，在這個戰爭結束的年代，自然是不能看著敵人擊殺風影，所以止水能做的，就只有放手去戰鬥。
琦玉的成長出乎他的意料，本以為自己已經追趕上對方步伐的止水隨著時間的流逝，應付起來也越漸吃力！
好在，最後雙方都開啟須佐能乎對碰，看上去都沒有占到多大優勢，至少對方想要殺掉自己或者風影，是絕無可能的？
於是琦玉離開了！
受了一些傷的止水看著琦玉轉身離開，儘管對方最後盯著自己看了那麼幾秒，但經歷太多的他很明白那個眼神的意義：下次，或許就是死戰？
而這次交手，也讓止水了解到琦玉當年『戰死』的一些內幕，這讓他感到憤怒！
回到村子，他將這些東西當作機密情報上報給了四代目火影波分水門，他相信對方會給出滿意的答覆。
但村子內部產生了分歧。
這是止水沒有想到的，所以事情就只能讓它繼續發展下去、無法挽回嗎？
他內心的憤怒、不解，在不斷拔高。
但是他並沒有放棄去『拯救』墮入黑暗的琦玉。
在他看來，那時候的琦玉一定是在無盡的黑暗之中掙扎後不得已選擇了融入黑暗。
作為曾經最好的同伴、朋友、兄弟，他相信自己就是那個伸出雙手拉住琦玉的人。
他肯定是有機會將對方拉扯出泥潭！
所以，那次見面之後，止水就一直關注著有關琦玉甚至他所在組織的消息。
後續又發生了許多的事情，而得知這些情報的第一時間，止水內心的希望就會被斬落數分。
曉組織的行動已經被各大忍村注意，而他也再次在任務之中遇到了作為敵人的琦玉。
和許久之前還抱著拯救心態的自己不同，這一次，止水已經不再那麼『天真』。
就好像琦玉面對他所說的那些話，他不曾親身體會是無法切實感同身受的！
那麼，這一次，止水已經不再抱著勸說琦玉的想法而來。
思想再激烈一些，行為再激進一些！
他決定將琦玉帶回去，不管是死是活！
但這次，琦玉的實力卻再次增長，或者說上次和他交手之時，琦玉還保留了一些實力。
於是，隨同著止水一起的同伴們一個個被擊敗，然後陷入瀕死的狀態。
琦玉不再留手，是真的抱著殺他們的態度而來。
止水沒有後悔自己的一系列決定，只是有些遺憾自己的實力還是不足以完成自己的想法。
當琦玉的忍術貫穿他胸口的時候，他知道自己死了，至少那顆心是死了！
兩人的身影，果然還是漸行漸遠了啊！
那次的任務，木葉的三代目戰死，而作為新生代的他們，也完全不是琦玉的一合之敵。
忍界，迎來了不可阻擋的變革？！
……
「我很想去理解你的痛苦，但我背後所想要保護的，是我們曾經說過必須守護的東西，家族、村子、同伴、親人、戀人……」
被譽為第四次忍界大戰拉開了序幕，深入地方腹地的止水再次遭遇了琦玉，沒有多少反抗之力，他落敗了！
而上次被忍術貫穿身體的情形幾乎一致，唯一不同的這次止水微笑著在說話。
他預料到了這一切，並且不覺得難以接受。
「現在好了，我雖然沒有能夠阻擋你的步伐，但是也盡力履行了自己的承諾！忍者的宿命，我已經看到！」
止水盯著面無表情的琦玉，輕聲說道。
「琦玉，或許這個世界確實應該得到改變，但遺憾的是…我沒有機會去欣賞你所謂的新世界！不過，你應該不會讓我感到失望吧？」
感受著身體上的疼痛，那貫穿身體的傷痕仿佛要將止水的靈魂吞噬乾淨，這種痛楚，很直觀。
幾乎是貼身在止水身前的琦玉停下自己的動作，他聽到了止水剛剛的吶吶自語，內心仿佛被觸動。
「抱歉！」
琦玉將自己的忍術從止水的身體中抽出，同時也帶走了對方僅剩的氣力和生命。