繁華的都市在晨曦那柔和而溫暖的映照之下，顯得熱鬧非凡。
林立的高樓大廈在朝暉中熠熠生輝，寬闊的街道上車輛川流不息，路邊的店鋪陸續開門營業，人們匆忙的身影穿梭其中。
然而，於這看似平和且充滿活力的表象之下，卻隱匿著無數鮮為人知的秘密與危機，猶如深不見底的暗流在平靜的水面下悄然涌動。
這天早上，應沖野洋子小姐那熱情的邀請，毛利小五郎以早安四分鐘直播間特邀嘉賓的身份來到了 NUT 大廈。柯南和毛利蘭也自然是跟隨著毛利小五郎一同前往了演播間。
當工作順利結束之後，沖野洋子小姐表現出極大的誠意，表示要請柯南他們三人享用一頓豐盛的美食，並且宣稱要為毛利小五郎介紹一位特別的朋友。
於是，毛利小五郎三人便在餐廳中耐心等待。不多時，只見沖野洋子小姐輕拉著另一位美麗動人的女士優雅地走進了餐廳。
接著，沖野洋子微笑著向雙方認真地做了介紹。水無怜奈，這位在業界美麗且知名的女主播，此刻正滿面憂色地緩緩坐在餐廳的椅子上。
「毛利偵探，此事實在太過怪異，門鈴連續兩月無故響起，我著實惶恐至極。」水無怜奈那略微顫抖的聲音仿佛帶著深深的恐懼。
毛利小五郎則是自信滿滿地拍著自己的胸脯，大聲說道：「水無小姐，您寬心，有我毛利小五郎出馬，必定能查個真相大白！」
一旁的柯南，眼鏡後的眼眸瞬間閃過一絲精明的光芒，暗自決意要協助毛利叔叔解開這個神秘的謎團。
隨後，一行人來到了水無怜奈位於米花町的家。柯南極為謹慎，在水無怜奈家門口的牆上悄然用口香糖粘上了發信器和竊聽器。
毛利小五郎一行人在和水無怜奈小姐進行進一步的交談中了解到，隔壁那原本空置了半年之久的房子竟莫名有了聲響。
柯南當機立斷，獨自翻過兩間房間共用陽台的遮擋，來到了隔壁的房間陽台門外。
可無奈的是，陽台門和窗戶都上了鎖，柯南只好暫時放棄，透過玻璃仔細地打量著房間裡的每一處角落，那雙敏銳的眼睛不肯放過任何一個細節。
最終，他在玻璃門上發現了「木、美、和」三個字。
毛利小五郎與柯南一道苦思冥想地試圖推斷這三個字的含義，卻始終如墜雲霧，毫無頭緒。
就在他們深深陷入困惑之時，水無怜奈一句不經意的話：「這會不會是某個人的名字呢？」瞬間如同一道閃電划過柯南的腦海，提醒了他。
柯南即刻打電話給警署進行確認，原來這竟是高木警官在此執行任務無聊時所寫下的。
次日的門鈴再度響起時，當門被迅速打開，卻並未看到任何人影。
柯南憑藉著他那超凡的聰慧才智，終於在門口成功擒住了按門鈴之人。
原來是水無怜奈的一個小粉絲。這個小男孩不知道水無怜奈因工作調動改成了夜班，以為她早上起不來就特意提供了叫醒服務。
還因擔憂她是因失眠導致早上起不來，特意拿了媽媽的安眠藥放在她家門口。
小男孩如此執著，只因為水無怜奈小姐那與他母親相似的長相，讓他深深懷念起因為交通事故已經去了天國的母親。
本以為一切已然終結，然而事情遠非如此簡單。
柯南無意中從牆上脫落粘在水無怜奈鞋上的竊聽器里獲悉，她居然是黑衣組織之人。
這個驚人的發現令柯南的心中瞬間湧起了巨大的波瀾，猶如驚濤駭浪一般。
在後續深入的調查進程中，柯南獲悉黑暗組織這次行動出動人數眾多，不僅有他熟悉的老熟人琴酒、伏特加、貝爾摩德，還有狙擊精英香緹、科倫，以及水無怜奈小姐 - 基爾。
由於雨勢漸大，那小小的竊聽器能獲取的情報被迫中斷。
為了進一步調查黑暗組織暗殺計劃的柯南，在決定前往黑暗組織幾人密謀的某大樓地下室時，竟意外邂逅了一直在追蹤可疑的水無怜奈小姐的 FBI 的茱蒂老師。
茱蒂老師在監視水無怜奈小姐時，意外發現毛利小五郎一行人進入了水無怜奈小姐的公寓。
之後，在準備取消跟蹤行動時，發現柯南一臉慌張地折返，便立刻悄悄跟在水無怜奈小姐身後，直到水無怜奈小姐刻意繞路，才沒再繼續深入追蹤。
柯南趕忙將自己竊聽到黑衣組織計劃在 艾迪 P 的地方殺一個叫 DJ 的人的事告知了她。
緊接著，柯南陷入了深深的沉思之中，雖然他在灰原關於「DJ 通常是 disco jockey」的說法和茱蒂老師的引申分析中，破解了 DJ 指的是父親是前防衛廳大官，自己本身也曾是自衛隊幹部的土門康輝，但是關鍵的狙擊地點艾迪 P 究竟在何處，依然毫無頭緒。
就在他急得焦頭爛額之際，他突然想起貝爾摩德的那句「名副其實的狩獵場」，貝爾摩德還讓伏特加「多少該研究一下那邊的歷史」，以及在水無怜奈家發現的那本《變身怪醫》，這些瞬間將他點醒。
柯南神色匆忙，趕忙讓阿笠博士驅車前往杯戶公園。「艾迪其實就是艾德華的簡稱。」柯南急切地向車上三人解釋道。
「原來如此，艾德華·海德，史帝文森的科幻小說《變身怪醫》的主角。」灰原那聰慧的眼眸中閃過一絲明悟。
「位於倫敦的那個真正的海德公園，一直到十六世紀左右為止是專屬於貴族們的狩獵區域。」柯南目光堅定，繼續有條不紊地說明。
此時，水無怜奈已經開始了採訪。柯南和茱蒂老師心急如焚，火速趕往現場。
為了破壞黑暗組織的暗殺計劃，茱蒂老師在柯南的提醒下，當機立斷地用槍破壞了附近的灑水器。
剎那間，水幕仿佛瀑布一般瞬間傾瀉而下，令所有人都猝不及防，以為是下起了傾盆大雨，大家紛紛手忙腳亂地持傘遮雨。
如此一來，樓頂的狙擊手香緹和科倫無法清晰瞄準射擊目標，此次精心策劃的暗殺計劃也只好暫且取消。
之後，柯南和茱蒂坐上了詹姆斯的車繼續進行追蹤，並從竊聽器中得知琴酒他們將在 VAIN B 進行暗殺。
柯南憑藉著他無人能及的敏銳洞察力，經過一番縝密的思考，推斷 VAIN B其實應該是VANE B也是就是鳥矢大橋。
然而，在前往鳥矢大橋的途中，道路上卻突然出現了一個天真懵懂的撿球小男孩。
為了不傷及無辜的小孩，包圍了水無怜奈的FBI探員毫不猶豫地猛打方向盤。
車子伴隨著尖銳的剎車聲停了下來，而為了逃跑而將摩托車開上車頂的水無怜奈的摩托車被甩飛出去猛地撞上了路邊的障礙物，她自己也因而受到了不輕的傷。
另一邊，被告知通話一直充斥著惱人的雜音，聲音幾乎被覆蓋的琴酒敏銳地察覺到了不對勁。
他那雙陰鷙的眼睛裡閃爍著狐疑的光芒，隨即在車上展開了仔細的搜尋。
一番尋覓過後，在水無怜奈換下的衣物里，他竟意外發現了粘在鞋底那熟悉得不能再熟悉的發信器和竊聽器。
這一發現，讓他瞬間火冒三丈，原本就陰沉的面龐此時更是布滿了令人膽寒的暴戾之氣，仿佛能滴出墨來。
怒火中燒之下，他當機立斷，臨時決定變更原本的目標，在取得boss的首肯之後，車子如離弦之箭般直奔米花鎮而去。
柯南察覺到了他們的行動，心中大驚，一顆心瞬間提到了嗓子眼，意識到了毛利小五郎的性命堪憂。
在柯南詢問過幫忙把毛利小五郎和毛利蘭藏起來的阿笠博士，得知毛利小五郎已經回到偵探事務所，他心急如焚，額頭上冒出了細密的汗珠，不停地催促著詹姆士加快速度，匆匆趕往米花鎮。
當他們終於抵達時，黑衣組織已經瞄準了毛利小五郎，扣在扳機上的手指即將發力。
千鈞一髮之刻，柯南沒有絲毫的猶豫，奮力踢出了足球。
足球猶如一顆威力巨大的炮彈一般，呼嘯著飛向毛利偵探事務所的玻璃窗，發出一聲巨響，成功阻止了他們的這次暗殺行動。
琴酒並沒有放棄，他打算把毛利小五郎和柯南一併除掉。他心中盤算著要將找到的口香糖送去進行 指紋和DNA 的提取鑑定，以此來獲取更多的線索和證據。
然而，就在這關鍵時刻，意外發生了。一顆子彈從後方以極速飛來，精準無誤地擊中了他手中的口香糖，瞬間就銷毀了這關鍵的證據。
而這枚子彈，乃是從他身後足足 700 碼遠的一棟高聳的大樓上射出的，開槍之人正是他的宿敵—FBI 的赤井秀一。
黑暗組織不得不放棄這次行動，狼狽地撤離。
米花鎮漸漸地恢復了往日的平靜，柯南心中暗自慶幸又一次守護了正義。
而這場與黑暗組織的驚心動魄的較量，還遠遠沒有終結……
由於基爾在見過毛利小五郎之後，竟就被安裝了竊聽器，並且竊聽器的形式和之前裝在琴酒車上的那個簡直如出一轍。
正因如此，琴酒滿心懷疑，認定毛利小五郎正在暗中調查黑衣組織，甚至還懷疑毛利小五郎就是當初那個將雪莉從絕境中救出來的神秘男人。
被黑暗組織派出的安室透，其肩負的主要目的乃是調查雪莉。
所以，他最先將目光鎖定的地方便是毛利偵探事務所。
只可惜，琴酒所能為他提供的有用情報僅有這麼微不足道的一點，這就致使安室透別無他法，只能以毛利小五郎作為關鍵的切入點。
小五郎身為私家偵探，平素里也著實沒有什麼同事，他的社交圈子相對而言比較固定，較為狹窄。
所以，對於安室透來說，接近小五郎的最為妥當的方式便是成為他的徒弟。
而且，安室透深深懷疑毛利小五郎和赤井之死存在著某種關聯，正因為如此，他才專門請求貝爾摩德為他提供協助，把他化妝成「疤痕赤井」，在赤井秀一FBI的同事及熟人周圍晃悠，確認赤井秀一身亡的已成事實才放下心。