除了調集援兵之外，朱燮元的第二個建議，就是堅壁清野。
這對民生的損害太大，也會讓天下人不安。朱由檢沒有完全實行，而是下命令道：
「通州等地的糧倉，要派兵馬守衛，儘量運到城裡來。」
「還有京內的糧倉，讓都察院和太府寺一起清查一遍。」
「該補上的就補上，儘快把城外的糧食運進來。」
「各地收穫的糧食也要運入城池，不要堆放野外。」
又擔心各地城池守不住，會被建虜破關後輕易攻下，朱由檢又下令道：
「命令各兵備道、守備區，進入戰備狀態。」
「各府縣的守備和縣尉，要在農忙後組織預備役訓練。」
「樞密院和都察院一起派人巡視，查看城牆防禦。」
「有餘力的府縣，允許參考棱堡修建銳角銃台。」
「人煙稠密的地方，也允許建立城寨自衛。」
這是徐光啟等人所建議的，在大凌河堡展示出強大的防禦能力後，再沒有人懷疑棱堡的有效性。
一些官員甚至提議，把大明所有城池都修築成棱堡。
但是這個工程量，目前的大明朝廷顯然負擔不起來。
所以朱由檢只允許一些富裕的府縣自行改建，在原本四四方方的城牆上，增加銳角銃台。
與棱堡搭配的是火器，朱由檢詢問畢懋康道：
「京城生產和存儲的火器有多少？」
「能不能下發到各地去？」
畢懋康聞言搖頭，說道：
「陛下提出裝備火器化後，各地軍隊都在索要火器，裝備部也在全力生產。」
「不過新式火器主要供應御營和巡捕營新軍，有富餘的也被京營和前線的大凌河堡要去，還有一些被調去朝鮮。」
「淘汰下來的火器大多被後勤部補給了遼東和薊鎮，無力支援地方。」
「但是各地庫存的應該有些武器，可以拉出來清點。」
朱由檢對地方上的武器保管情況根本不抱希望，但是此時能增加一分力量算一分，所以他向閔夢得道：
「軍械採購保養，歸後勤部軍械司負責。」
「後勤部要和監軍總署一起派人去地方清點武器，設專人負責武庫，定期查驗狀況。」
「以前的情況只要不過份可以不追究，但是後勤部派專人接管以後，必須明明白白。」
「否則出了事先追究後勤部的責任，再追究地方官員。」
這讓閔夢得叫苦，知道攤上了苦差事。
不過後勤部油水這麼大，皇帝盯得緊一點，也是情有可原。
借著整軍備戰，朱由檢向樞密院各個部門下令，清查北直隸的武備情況。
——
在這些都做出安排後，沉默良久的楊嗣昌，又突然道：
「臣以為北直隸整軍備戰固然重要，但是更重要的，是大凌河之戰。」
「可令遼東騎兵出動，在大凌河虛晃一槍，牽制建虜兵力。」
「甚至用信號塔和大凌河守軍約好時間，讓大凌河守軍出動，和遼東騎兵內外夾擊。」
這是他針對前線戰況提出的建議，樞密院的官員，對此大多同意。
整個北直隸的兵馬調動，動靜實在太大了。還不如讓遼東兵馬出動，把建虜吸引在那裡。
就算遼東損失些兵馬，也好過京城遇危。
朱由檢初聽還覺得有些道理，認為只要再拖過一年，自己的力量會更強大。
但是在見到樞密院的官員紛紛附和，對大凌河之戰提出各種建議，甚至連火炮的方位都要安排後，他卻驀然警覺：
不能干涉前線戰事！
這讓他眉頭緊皺，盯著楊嗣昌喝問道：
「直接干涉前線戰事。」
「你是想學宋朝的樞密院嗎？」
「參謀部的方略，可能保證勝利？」
楊嗣昌臉色一白，瞬間明白了皇帝為何會不快。
直接干涉前線戰事，向來是戰爭中的大忌。
熟讀兵書戰策的他對此不是不知，清楚這樣做的後果，通常就是失敗。
宋朝是其中典型，凡是打仗都會由皇帝或樞密院制定陣圖，然後讓帶兵將領必須按照陣圖布置。
結果自然可想而知，在戰爭中經常遭遇失敗。
如今樞密院剛剛設置，他就開始犯前宋樞密院的錯誤。
這讓楊嗣昌明白，他此舉犯了大忌。 急忙跪下請罪，楊嗣昌道：
「臣一時糊塗，請陛下恕罪。」
「但臣以為朝廷既然能和前線通信，提出方略也是應有之意。」
「畢竟前線的將領所看到的只是一隅，朝廷看到的是全局。」
仍舊認為應該把參謀部的方略，發到遼東前線去。
樞密院的官員也大多認同楊嗣昌，認為在如此便捷的通信條件下，應該加強對前線的指揮。
甚至一些人還想到皇帝提出的方陣等陣型，覺得當今皇帝表面反對，其實心裡還有些想學前宋皇帝。
朱由檢對此搖頭嘆氣，因為他知道就算後世有了電報和電話，後方也不能把前線將領當成提線木偶。
畢竟前線的戰事瞬息萬變，後方再怎麼也反應不過來。必須給前線將領指揮作戰的權力，讓他們發揮出能力來。
如今大明樞密院這些人因為有了臂板通信，就急慌慌地擴大指揮權力，在他看來實在是不知所謂。
這讓他仔細思索之後，明確向群臣道：
「大明的樞密院，不是前宋的樞密院，不需要只會紙上談兵布陣圖的人。」
「方陣、圓陣、車陣等陣法的操練，都屬於平時訓練，也是常規戰法。」
「但它們並不能涵蓋所有情況，指揮作戰要按岳武穆所說：」
「陣而後戰，兵法之常，運用之妙，存乎一心。」
「這是北宋變成南宋後將領的體會，爾等務必汲取教訓！」
拿岳飛的言語和北宋變成南宋做例子，朱由檢嚴厲訓斥了樞密院官員一通，又給他們劃線：
「朝廷負責戰略規劃，前線負責戰術指揮。」
「朝廷可向前線將領提出任務目標，但是如何作戰，要由前線將領自己判斷。」
「如果樞密院覺得他做得差，可以發函訓斥，要求做出解釋，甚至就地解職，讓其他人替代。」
「但是調遣麾下哪些兵馬、執行什麼樣的作戰方案，是前線將領的權力。」
「非有緊急情況，不得越級指揮。」
「尤其是某些人越一級還不夠，想要越兩級、三級。」
這讓楊嗣昌臉色更白，知道皇帝說的就是自己。
剛才他提出的策略，直接越過了遼東方面軍，還越過錦州總兵，直接指揮大凌河戰事。
這對軍中將領的權威，可謂極大的破壞。長此以往下級會養成觀望的習慣，在上級下令之後，仍會等朝廷的命令。
想到這個後果，袁可立也不得不出言道：
「軍中確實不該越級指揮，樞密院平時的指揮權力，應該限制在師級。」
「而且在師上面有軍時，要先通報給方面軍。」
朱由檢點頭認可，又向楊嗣昌道：
「記住，參謀部不是軍令部，只有出謀劃策的權力。」
「樞密院執掌軍令，參謀部的方案必須得到樞密院認可後，才能轉為軍令。」
「在轉化為軍令之前，如果參謀部從全局發現什麼關鍵之處，可以向前線發出提示。」
「前線如果置之不理，出了問題由他們擔責任。」
「具體的作戰方案也是如此，是否採納由前線將領決斷。」
「除非得到樞密院認可，參謀部不得私自發布軍令。」
對參謀部的權力做出明確限制，朱由檢為了讓那些參謀警醒，又處罰楊嗣昌道：
「楊嗣昌違背軍中規矩，加銜降低一級。」
「眾卿要引以為戒，不要隨意越線。」
拿楊嗣昌殺雞儆猴，遏制參謀部指揮前線戰事的衝動。
讓樞密院的官員，同樣引以為戒。
為了防止樞密院和參謀部用其他方式影響前線戰事，朱由檢對戰爭中的人員調動、賞賜懲罰等方面也做出了限制，規定在前線沒有提出請求時，樞密院不得在戰爭中隨意下令。
不能因為有了臂板通信，就在戰鬥中指手劃腳，讓前線將士無所適從。
臂板通信可發揮其它方面的作用，例如向前線通報敵人的動向、己方軍隊的調動、朝廷發生的大事、甚至為將士傳遞家書……都比胡亂指揮有意義。
軍中文書也做出嚴格規範，把正式軍令和參謀建議區分開。
而且為了加強參謀部的專業性，朱由檢下令設立邊防軍參謀司、海軍參謀司，在兩軍設置參謀長，以副總參謀長身份加入參謀部。參謀部對邊防軍和海軍發出公文時，需要他們副署。
各個方面軍也要像京營禁軍一樣設立參謀司，師級設立參謀廳。以參謀長為主官，負責接收和研究參謀部的建議，並且在必要時接替將領指揮。
前線的指揮順序，也被一再強調，確定戰爭中的第一指揮官和負責人。
對於大凌河堡來說，就是確定了何可綱對大凌河之戰的指揮權。在戰事擴大為錦州之戰、遼東之戰之前，就算是錦州總兵和遼東提督，也無權干涉何可綱的指揮。
他和護軍都尉霍維華，就是大凌河之戰的第一、第二負責人。(本章完)